En el laboratorio de Biogeoquímica de Ecosistemas Tropicales se realiza investigación sobre los ciclos de nutrientes, principalmente del carbono, nitrógeno y fósforo, con un énfasis particular en los ecosistemas tropicales estacionalmente secos. Se trabaja con los nutrientes en los flujos hirdrológicos (lluvia y escorrentía), en los procesos vegetales y en el suelo. El trabajo analítico en el laboratorio (determinaciones de nutrientes en agua, suelo y vegetación), así como la supervisión del funcionamiento y el mantenimiento de los equipos se realiza bajo la coordinación de la M. en C. Maribel Nava. Ella es la responsable también de capacitar a los estudiantes que realizan trabajo analítico en el laboratorio, tanto a los propios como a los de investigadores que colaboran con nosotros. Un componente muy importante de la investigación que se realiza está vinculado con el estudio de largo plazo que se lleva a cabo en cinco pequeñas cuencas en la Reserva de la Biósfera Chamela-Cuitzmala, en el que se monitorean los flujos de agua, energía y nutrientes. En este proyecto se colabora estrechamente con la Dra. Angelina Martínez Yrízar (Instituto de Ecología, UNAM) y con el Dr. José Manuel Maass (CIEco, UNAM), corresponsables del mismo, desde 1991. El trabajo de campo del proyecto (recolección y manejo de muestras de agua, suelo y material vegetal, entre otras actividades) es realizado por el Ing. Salvador Araiza y el Sr. Abel Verduzco. El laboratorio participa en la Red Mexicana de Investigación Ecológica a Largo Plazo (Red Mex-LTER) como parte del Grupo Chamela y en la Red Latinoamericana de Nitrógeno.